药王出山以主人公韩野的人生机遇展开，韩野十几岁就父母双亡。他一个人孤立无援，为了生存，他给村里放羊，成为一个小羊倌。
他只是一个小孩子，没有人在意他的生与死，只有一位本家的三叔三婶，给了他一些关爱。
韩野孤独，无助，但他不服输，后来他在山上放羊遇到一位山上寺庙里的老和尚。
老和尚教他识字，武功，并传授了他鲜为人知医学。韩野想改变人生，但感觉无力。
正巧一场大雨，让他躲进了无人敢进的神秘山洞，洞穴里满地金银宝物，却没有勾起韩野贪婪之心。
正是韩野的品格，得到了山洞中，来自另一空间的异能女子的欣赏，他得到了一只神眼珠，从此，各种势力在他周围暗流涌动，开始了他波诡云谲而又叹为观止的一生。
山外的美女宋欣在自己不愿意的情况下，被山洞中的异能女子托梦，来大山中寻找韩野，两人从最初的误会到后来得生死不弃，演绎了一段又一段的爱恨情仇，化解了一场接一场的危机。